به منظور انجام یک شبیه سازی دقیق و علمی نیاز است که از تکنیک هایی برای این منظور استفاده شود. بنابراین در این فیلم آموزشی تکنیک ها و مفاهیم بصورت ساده طبق سر فصل زیر ارائه می شود.
- سرعت اولیه
- تعادل و نمونه گیری
- شرایط مرزی متناوب
- کمینه سازی انرژی
- شعاع قطع
- ترموستات
- باروستات
- تابع توزیع شعاعی (RDF)
- متوسط مجذور جابجایی (MSD)
لازم به ذکر است که تک تک این تکنیک ها و مفاهیم الگوریتم های بسیار پیچیده دارند که اطلاع دقیق از آنها در روند شبیه سازی اثر چندانی ندارد، بنابراین فقط به روابط ساده، مفاهیم و کاربردهای آنها اشاره می شود.
تکنیک ها، جزئیات و آنالیزهای مربوط به شبیه سازی مولکولی