ایشان در نهم ربیع الاول سال 1349 هجری قمری و در خانواده ای متدین و مشهور به علم و دانش در مشهد مقدس به دنیا آمدن.اجداد ایشان اصالتا اهل اصفهان بودند.سید محمد(جد اعلای ایشان) که از سادات علوی حسینی و از نوادگان فیلسوف شهیر ، سید محمد باقر داماد میباشد به عنوان شیخ الاسلام(امام جمعه) از طرف حکومت شاه سلیمان صفوی در منطقه ی سیستان منصوب شد و به آن جا هحرت کرد.از این رو ،این خاندان،به ((سیستانی)) معروف شدند.اولین نفری که از سیستان به مشهد مهاجرت کرد و سپس برای تحصیل به نجف رفت سید علی بود.
وی از شاگردان ملاعلی نهاوندی در نجف اشرف، و از شاگردان میرزا محمد حسن شیرازی در سامرّا بود. وپس از آن در زمره خواص سیداسماعیل صدر در آمد و در حدود سال 1318 هجری به مشهد امام رضا (علیه السلام) بازگشت و در آن جا رحل اقامت افکند و با بهره وافری که از دانشِ و پارسایی و صلاح برده بود، به جایگاه بلندی دست یافت.
در میان شاگردان نام آور او می‌توان از فقیه بزرگ شیخ محمد رضا آل یاسین (قدس سره) یاد نمود.
دانلود پاورپوینت زندگی نامه ایت الله سیستانی - 18 اسلاید